MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 3

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008539	GGC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008539	CGT	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008539	CCTC	2	8	4806	4813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008539	AGG	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008539	GTC	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008539	TCC	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008539	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008539	CTT	2	6	5473	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008539	GCG	2	6	5578	5583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008539	ATT	2	6	6779	6784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008539	GTA	2	6	6788	6793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008539	A	7	7	6793	6799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008539	TAC	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008539	GC	3	6	6812	6817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008539	CGAC	2	8	6861	6868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008539	CCT	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008539	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008539	CGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008539	CCG	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008539	GCC	2	6	7056	7061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008539	ACA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008539	TCG	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008539	CCT	2	6	9313	9318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008539	ACA	2	6	9342	9347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008539	GGT	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008539	CGC	2	6	9394	9399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008539	GAAG	2	8	9401	9408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008539	T	6	6	9565	9570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008539	GCC	2	6	11714	11719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008539	CAA	2	6	11739	11744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008539	AGG	2	6	11759	11764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008539	GCC	2	6	11810	11815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008539	ACT	2	6	12307	12312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008539	T	7	7	12316	12322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008539	G	6	6	12418	12423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008539	TAG	2	6	12424	12429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008539	GCC	3	9	12473	12481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008539	CACC	2	8	12907	12914	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_008539	AAG	2	6	12926	12931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008539	GAT	2	6	12970	12975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008539	TG	3	6	12981	12986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008539	CCG	2	6	12994	12999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008539	CCG	2	6	14616	14621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008539	CA	3	6	14635	14640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008539	GAA	2	6	14647	14652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008539	ACC	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008539	CAC	2	6	16121	16126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008539	AGG	2	6	16137	16142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008539	CAA	2	6	17052	17057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008539	GCG	2	6	17885	17890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008539	GAC	2	6	17900	17905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008539	CAA	2	6	17911	17916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008539	GAC	2	6	17956	17961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008539	GCC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008539	GCA	2	6	21055	21060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008539	CTG	2	6	21670	21675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008539	TGG	2	6	21782	21787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008539	GCC	2	6	21816	21821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008539	GCC	2	6	21848	21853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008539	T	6	6	21854	21859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008539	AACT	2	8	21950	21957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008539	CCG	2	6	22001	22006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008539	CG	3	6	22017	22022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008539	CAGGC	2	10	22030	22039	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008539	GCACCG	2	12	22098	22109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008539	CCCT	2	8	22126	22133	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_008539	CCA	2	6	22747	22752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008539	CCGG	2	8	22776	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008539	GC	3	6	22794	22799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008539	CCG	2	6	24505	24510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008539	CGGCC	2	10	24542	24551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008539	GCCGGG	2	12	25026	25037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008539	GAC	3	9	25052	25060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008539	GAC	2	6	25209	25214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008539	G	7	7	25343	25349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008539	GGCCG	2	10	25358	25367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008539	TCG	2	6	25377	25382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008539	CGG	2	6	25440	25445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008539	ATGCA	2	10	25868	25877	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008539	TGA	2	6	25908	25913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008539	GAA	2	6	27406	27411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008539	ACC	2	6	27424	27429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008539	CGG	2	6	27460	27465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008539	CCGG	2	8	27522	27529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008539	TTCA	2	8	27593	27600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008539	G	6	6	29173	29178	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008539	GAAC	2	8	29183	29190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008539	CCA	2	6	29798	29803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008539	GCC	2	6	29821	29826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008539	GCT	2	6	29835	29840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008539	CAT	2	6	29876	29881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008539	GC	3	6	30889	30894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008539	TCAA	2	8	30911	30918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008539	CCAG	2	8	30932	30939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008539	TCC	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008539	GCG	2	6	32368	32373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008539	GTG	2	6	32416	32421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008539	GTT	2	6	32532	32537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008539	ATG	2	6	32546	32551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008539	CGG	2	6	33505	33510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008539	CCG	2	6	33511	33516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008539	AGC	2	6	33519	33524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008539	CGC	2	6	33537	33542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008539	GTGG	2	8	36408	36415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008539	ATA	2	6	36442	36447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008539	GCGTG	2	10	36494	36503	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008539	ACC	2	6	36521	36526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008539	AGG	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008539	GA	3	6	37245	37250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008539	TGC	2	6	37373	37378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008539	GGC	2	6	37407	37412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008539	TTC	2	6	37417	37422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008539	CGG	2	6	37425	37430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008539	GC	3	6	38537	38542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008539	ATC	2	6	38608	38613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008539	AC	3	6	42226	42231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008539	AGG	2	6	42888	42893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008539	CCATC	2	10	44266	44275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_008539	ATCC	2	8	44372	44379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008539	GCCA	2	8	44719	44726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008539	GTT	2	6	44749	44754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008539	GGC	2	6	50674	50679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008539	GCG	2	6	50684	50689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008539	GCC	2	6	52143	52148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008539	CCA	2	6	52160	52165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008539	GAGC	2	8	52192	52199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008539	TCG	2	6	52231	52236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008539	TCG	2	6	52242	52247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008539	CCGAA	2	10	52267	52276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008539	CTC	2	6	52353	52358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008539	AGG	2	6	52388	52393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008539	TGG	3	9	59043	59051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008539	ATCC	2	8	61070	61077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008539	CAGCG	2	10	61089	61098	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008539	ACC	2	6	61141	61146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008539	CAA	2	6	61158	61163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008539	TCT	2	6	61205	61210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008539	CAG	2	6	61264	61269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008539	GAACCA	2	12	62515	62526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008539	GAC	2	6	62603	62608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008539	CAC	2	6	62631	62636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008539	CCGA	2	8	62650	62657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008539	CGG	2	6	62675	62680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008539	GCT	2	6	62742	62747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008539	GGC	2	6	62798	62803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008539	GAA	2	6	62820	62825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_008539	ACCA	2	8	95751	95758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_008539	CTT	2	6	95787	95792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_008539	TAA	2	6	96451	96456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.